Akatsuki
L'Akatsuki, une organisation révolutionnaire fondée par Yahiko, Nagato et Konan dans le village caché d'Amegakure, visait initialement à apporter la paix à leur pays ravagé par les guerres entre les grandes nations shinobi. Black Zetsu avait secrètement orchestré la création de l'organisation dans le but de ressusciter sa mère, bien qu'il ait fait croire que l'idée venait de Madara Uchiha. Après que Yahiko soit tué par Hanzo sur les ordres de Danzo, Nagato prit la tête de l'Akatsuki sous l'alias de Pain, adoptant une philosophie selon laquelle seule une destruction massive pourrait apporter une paix durable au monde. L'organisation devint l'une des plus puissantes forces rebelles de l'univers Naruto.
L'Akatsuki original fut fondé par Yahiko aux côtés de ses amis d'enfance Nagato et Konan, tous trois orphelins d'Amegakure victimes des guerres précédentes. Ils crurent que seule une organisation unifiée pourrait mettre fin aux conflits constants qui ravageaient leur terre. Bien que Black Zetsu et Tobi tentèrent d'influencer l'organisation, c'est le charisme naturel et le leadership de Yahiko qui maintinrent les rangs unis et motivèrent les autres à persévérer malgré les difficultés de leur noble objectif. Cependant, Hanzo, le leader d'Amegakure, reconnut en l'Akatsuki une menace à son pouvoir et orchestrera la mort de Yahiko, transformant profondément l'organisation.
Après la mort de Yahiko, Nagato prit la tête de l'Akatsuki en adoptant le titre de Pain et formant les Six Voies de Pain en y intégrant le corps de Yahiko pour continuer symboliquement son leadership. Convaincu que le monde ne consentirait jamais volontairement à la paix, Nagato conclut que seule une démonstration cataclysmique de destruction et de mort pourrait détourner l'humanité de ses conflits constants. L'organisation recruta systématiquement les ninjas manqués de rang S en les forçant à rejoindre les rangs et en promettant de protéger leurs objectifs personnels. Utilisant une stratégie économique élaborée, l'Akatsuki devint progressivement la plus puissante force rebelle du monde.
Tobi, la manifestation cachée d'Obito Uchiha, approcha l'Akatsuki afin de se rapprocher de Nagato dont il convoitait le Rinnegan pour accomplir le Plan de l'Oeil de la Lune. Tout en restant dans l'ombre et en laissant Nagato diriger nominalement l'organisation, Obito la manipula secrètement pour capturer l'ensemble des neuf bêtes à queues et restaurer le Dix-Queue. Après la mort de Nagato, Obito prit progressivement le contrôle de l'Akatsuki et initia la Quatrième Grande Guerre Shinobi face aux cinq grandes nations ninjas. Il redéfinit complètement les objectifs de l'organisation autour de son propre plan de domination mondiale.
Environ quinze ans après la fin de la Quatrième Grande Guerre Shinobi, Shin, un ancien sujet d'expérimentation d'Orochimaru, adopta le nom Uchiha et créa une nouvelle Akatsuki composée de ses propres clones, croyant que les conflits infinis stimulaient l'évolution humaine. Obsédé par Itachi Uchiha, Shin planifiait de se venger de Sasuke et de ressusciter les idéaux de chaos perpétuel de l'ancienne organisation. Cependant, ses plans échouèrent rapidement quand ses propres clones le trahirent et le tuèrent après avoir perçu le Kurama dans le subconscient de Naruto. Ceci mit fin à cette nouvelle incarnation de l'Akatsuki avant même qu'elle ne s'établisse véritablement.
Sous le commandement de Nagato, chaque membre de l'Akatsuki reçut l'un des dix anneaux à porter sur un doigt précis, anneaux apparemment liés au processus de scellement des bêtes à queues dans la Statue du Chemin de la Voie Externe. Bien que signifiant formellement l'appartenance à l'organisation, les anneaux semblaient indiquer sur quel doigt de la statue chaque membre devait se tenir lors du scellement rituel. Les anneaux possédaient une importance irremplaçable : quand Orochimaru fit défection, il garda son anneau et ne fut jamais officiellement remplacé. Zetsu et Tobi recherchèrent spécifiquement l'anneau de Sasori après sa mort, la signification exacte de ces objets restant à jamais mystérieuse.
Sous Nagato, les membres de l'Akatsuki étaient organisés en équipes de deux, généralement appairés selon des similarités perçues ou des combinaisons d'avantages tactiques, bien que peu de membres semblaient réellement s'apprécier mutuellement. Nagato et Konan constituaient la seule équipe qui se soutenait constamment, en tant qu'amis d'enfance et fondateurs originels de l'organisation. Chaque équipe voyagea à travers le monde en poursuivant les objectifs de l'Akatsuki, ne se réunissant que quand convoquée par Nagato. Ces réunions avaient généralement lieu pour capturer une bête à queues et la sceller dans la Statue du Chemin de la Voie Externe.
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