Poison
Différents types de poison existent avec des efficacités variables selon leur composition et leur application au combat. Tsunade a été remarquée par Jiraiya comme la seule capable d'empoisonner un ninja sans qu'il s'en aperçoive, ayant versé un poison inodore et incolore dans le sake qui l'empêchait de contrôler correctement son chakra. Ino Yamanaka possédait des connaissances sur les plantes toxiques, les utilisant efficacement contre ses ennemis. Sasori avait développé un poison si concentré que même une infime quantité introduite dans la circulation sanguine provoquait la mort en deux ou trois jours, accompagnée d'une paralysie douloureuse, raffiné avec des métaux lourds qui s'accumulaient dans les muscles. L'antidote à ce poison était extrêmement complexe, si bien que personne à Sunagakure ne pouvait le créer.
Le sang de la forme véritable d'Orochimaru est toxique et s'évapore au contact de l'air, paralysant quiconque le respire avec une potence telle que même Sasuke Uchiha, rendu immun à la plupart des poisons, en était affecté. L'un des poisons enseignés à Sakura par Shizune pouvait être appliqué sur des kunai avec un effet différé, permettant à Naruto de s'effondrer longtemps après sa blessure. Sakura utilisait également des bombes fumigènes contenant un gaz asphyxiant puissant capable d'endormir rapidement des ninjas comme Sai, Lee et Kiba. Kabuto Yakushi avait développé un poison conçu spécifiquement pour supprimer le kekkei genkai de Libération du Bois. De nombreuses espèces animales pouvaient produire différents types de venins : les serpents invoqués par Orochimaru pouvaient sécréter du venin de leurs crocs ; Ibuse relâchait un brouillard toxique paralysant instantanément ceux qui l'inhalaient.
Aniki, le chef de la Triade Moya, avait expérimenté plusieurs types de poison contre Kakashi conçus pour le faire hoquet, rire ou pleurer sans contrôle jusqu'à sa mort par épuisement. Le clan Kamizuru d'Iwagakure possédait des abeilles ninjas capables d'injecter du venin par leurs dards lors d'attaques coordonnées. Le Clan des Ninjas Errants utilisait une poudre toxique inodore ralentissant les sens et les réactions de la victime au combat. Fuen avait développé une poudre empoisonnée provoquant des hallucinations contrôlées chez ceux qui l'inhalaient. Le Gang de la Route Silencieuse utilisait le Champignon de Remodelage pour empoisonner ses victimes et les rendre vulnérables aux manipulations. La Terre de la Brume était spécialisée dans un poison pouvant tuer instantanément ses victimes.
Certains personnages aux compétences en chimie et biologie pouvaient produire des antidotes aux poisons les plus dangereux ; Tsunade, durant la Deuxième Grande Guerre Shinobi, réussit à créer des antidotes à tous les poisons de Chiyo, ce qui irrita considérablement cette dernière. Durant la mission de sauvetage de Gaara, Sakura Haruno démontra une aptitude exceptionnelle à non seulement extraire et analyser le poison de Sasori rapidement, mais aussi à produire un antidote efficace. Un ninja pouvait aussi se construire une tolérance progressivement en s'exposant à des doses non-létales de poison ; Orochimaru rendit Sasuke immun à la plupart des poisons en vue de le préparer comme vase parfait. Quand Naruto fut empoisonné par les Frères Démons, Kakashi lui expliqua qu'on pouvait traiter la blessure en la coupant et laissant le sang évacuer le poison du corps.
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